Die Stiftung Basler Islamisches Zentrum verfolgt folgende Zwecke, welche auf den Prinzipien und erzieherischen Massnahmen verschiedener Gelehrter beruhen. Im Falle einer Naturkatastrophe, geschehe sie in der Schweiz oder in der Türkei, wird denjenigen, die geschädigt wurden und Hilfe benötigen, alle mögliche Unterstützung geboten. Zudem werden Spendenaktionen eröffnet. Für diejenigen SchülerInnen und StudentInnen, die in der Schule/im Studium erfolgreich sind und sich in einer wirtschaftlichen Notlage befinden, kommt die Stiftung für Stipendien auf. Für Kinder, die in der Türkei oder in Kurdistan leben und deren Vater verstorben ist, leistet die Stiftung finanzielle Hilfe. Die Stiftung hilft Türken und Kurden, die in der Schweiz leben, bei deren Integration. Dies geschieht durch vorbereitete Projekte. Zudem werden unter anderem Sprach-, Musik- und Volkstanzkurse durchgeführt. Für Muslime, die in der Schweiz leben, errichtet die Stiftung Gebetshäuser, damit sie ihren Glauben ausüben können. Speziell dafür geeignete Fachleute aus der Türkei werden dazu beitragen, damit die Ausübung des muslimischen Glaubens vollbracht werden kann. Die Stiftung unterstützt die in der Schweiz lebenden Muslime, die wegen ihres Glaubens Schwierigkeiten oder Probleme haben oder deswegen diskriminiert werden. Dabei wird versucht, gemeinsame Lösungen zu finden. Die Stiftung pflegt den Dialog mit allen in der Schweiz sesshaften muslimischen und nicht muslimischen Religionsgemeinschaften. Die Stiftung Basler Islamisches Zentrum erklärt sich als politisch neutral.